У даному законопроекті передбачається, що депозитарна система обліку буде існувати на двох рівнях, тобто будуть існувати депозитарні установи і депозитарії.
Крім того, законопроектом пропонується уніфікація принципів та порядку здійснення діяльності учасниками нижнього рівня Національної депозитарної системи та взаємодії між ними, розвиток окремих видів професійної діяльності на ринку цінних паперів (в першу чергу кастодіальної та розрахунково-клірингової), тощо.
Таким чином, проект Закону України "Про систему депозитарного обліку цінних паперів" покликаний удосконалити діючу депозитарну систему, покращуючи та адаптуючи її до змін, відповідно до тенденцій на світових фінансових ринках, приймаючи до уваги міжнародні стандарти та рекомендації депозитарного обліку цінних паперів.